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Enregistrement W2109330400 · doi:10.1093/glycob/cwp078

Catabolism of flocculosin, an antimicrobial metabolite produced by Pseudozyma flocculosa

2009· article· en· W2109330400 sur OpenAlex
Benjamin Mimee, C. L’abbé, Richard R. Bélanger

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCatabolismBiochemistryChemistryMetaboliteCellobioseEnzymeYeastAntimicrobialBacteriaDegradation (telecommunications)GlycolipidMicrobiologyBiologyOrganic chemistryCellulase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Flocculosin is an unusual cellobiose lipid secreted by the yeast-like fungus Pseudozyma flocculosa as part of its biocontrol arsenal against other fungi. Recent observations have suggested that the fungus degrades flocculosin to use it as a nutrient source during periods of food limitation. In this work, we sought to identify the catabolic steps leading to the degradation of flocculosin and its subsequent use by P. flocculosa. To this end, we characterized the catabolism of flocculosin through identification of degradation intermediates in a deprived medium using mass spectrometry. As the pH of the medium increased, the molecule was quickly deacylated and lost its antimicrobial activity thereby explaining conflicting results concerning the antimicrobial activity of this class of glycolipid. Following removal of both acetyl groups and the short fatty acid chain under alkaline conditions, the molecule was quickly and completely metabolized by P. flocculosa. Protein purification of culture filtrates confirmed the presence of degradative enzymes produced by P. flocculosa. These enzymes were found to degrade 3,15-dihydroxy-hexadecyl cellobioside (DHC) but not the acylated molecule, thus confirming the protective role of these groups against catabolism. These results are the first evidence of glycolipid degradation by producing organism and suggest that flocculosin can be recycled by P. flocculosa as a nutrient in addition to protecting its ecological niche.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,972

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle