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Enregistrement W2109600062 · doi:10.1073/pnas.1219992110

Genome-wide reprogramming of the chromatin landscape underlies endocrine therapy resistance in breast cancer

2013· article· en· W2109600062 sur OpenAlex
Luca Magnani, Alexander Stoeck, Xiaoyang Zhang, András Lánczky, Anne Mirabella, Tian‐Li Wang, Balázs Győrffy, Mathieu Lupien

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteDartmouth College
Mots-clésBreast cancerReprogrammingEndocrine systemBiologyDrug resistanceTranscription factorCancerChromatinNotch signaling pathwayTargeted therapyCancer researchGenetic enhancementOncologyGeneMedicineInternal medicineEndocrinologyGeneticsHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The estrogen receptor (ER)α drives growth in two-thirds of all breast cancers. Several targeted therapies, collectively termed endocrine therapy, impinge on estrogen-induced ERα activation to block tumor growth. However, half of ERα-positive breast cancers are tolerant or acquire resistance to endocrine therapy. We demonstrate that genome-wide reprogramming of the chromatin landscape, defined by epigenomic maps for regulatory elements or transcriptional activation and chromatin openness, underlies resistance to endocrine therapy. This annotation reveals endocrine therapy-response specific regulatory networks where NOTCH pathway is overactivated in resistant breast cancer cells, whereas classical ERα signaling is epigenetically disengaged. Blocking NOTCH signaling abrogates growth of resistant breast cancer cells. Its activation state in primary breast tumors is a prognostic factor of resistance in endocrine treated patients. Overall, our work demonstrates that chromatin landscape reprogramming underlies changes in regulatory networks driving endocrine therapy resistance in breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,622
Score d'incertitude au seuil0,170

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle