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Enregistrement W2109678687 · doi:10.1093/dnares/dsm012

Radiation Hybrid Maps of Medaka Chromosomes LG 12, 17, and 22

2007· article· en· W2109678687 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueDNA Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesExploratory Research for Advanced TechnologyJapan Science and Technology Agency
Mots-clésBiologyGeneticsGenomeRadiation hybrid mappingGene mappingChromosomeCloning (programming)GenotypingGeneBacterial artificial chromosomeComputational biologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Medaka is an excellent genetic system for studies of vertebrate development and disease and environmental and evolutionary biology studies. To facilitate the mapping of markers or the cloning of affected genes in Medaka mutants identified by forward-genetic screens, we have established a panel of whole-genome radiation hybrids (RHs) and RH maps for three Medaka chromosomes. RH mapping is useful, since markers to be mapped need not be polymorphic and one can establish the order of markers that are difficult to resolve by genetic mapping owing to low genetic recombination rates. RHs were generated by fusing the irradiated donor, OLF-136 Medaka cell line, with the host B78 mouse melanoma cells. Of 290 initial RH clones, we selected 93 on the basis of high retention of fragments of the Medaka genome to establish a panel that allows genotyping in the 96-well format. RH maps for linkage groups 12, 17, and 22 were generated using 159 markers. The average retention for the three chromosomes was 19% and the average break point frequency was approximately 33 kb/cR. We estimate the potential resolution of the RH panel to be approximately 186 kb, which is high enough for integrating RH data with bacterial artificial chromosome clones. Thus, this first RH panel will be a useful tool for mapping mutated genes in Medaka.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,047
Score d'incertitude au seuil0,234

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle