Clinical Performance of the PreTect HPV-Proofer E6/E7 mRNA Assay in Comparison with That of the Hybrid Capture 2 Test for Identification of Women at Risk of Cervical Cancer
Notice bibliographique
Résumé
Human papillomavirus (HPV) DNA testing has a higher clinical sensitivity than cytology for the detection of high-grade cervical intraepithelial neoplasia or worse (CIN 2+). However, an improvement in specificity would be desirable. As malignant transformation is induced by HPV E6/E7 oncogenes, detection of E6/E7 oncogene activity may improve specificity and be more predictive of cervical cancer risk. The PreTect HPV-Proofer assay (Proofer; Norchip) detects E6/E7 mRNA transcripts from HPV types 16, 18, 31, 33, and 45 with simultaneous genotype-specific identification. The clinical performance of this assay was assessed in a cross-sectional study of women referred for colposcopy in comparison with the Hybrid Capture 2 (HC2; Qiagen) test, which detects DNA of 13 high-risk oncogenic HPV types collectively. Cervical specimens were collected in PreservCyt, and cytology was performed using the ThinPrep method (Hologic). The samples were processed for HPV detection with Proofer and HC2 and genotyping with the Linear Array method (Roche Molecular Systems). Histology-confirmed CIN 2+ served as the disease endpoint to assess the clinical performance of the tests. A total of 1,551 women were studied, and of these, 402 (25.9%) were diagnosed with CIN 2+ on histology. The Proofer assay showed a sensitivity of 78.1% (95% confidence interval [CI], 74.1 to 82.1) versus 95.8% (95% CI, 93.8 to 97.8) for HC2 (P < 0.05) and a specificity of 75.5% (95% CI, 73.0 to 78.0) versus 39.6% (95% CI, 36.8 to 42.4), respectively (P < 0.05). The lower sensitivity and higher specificity of Proofer for detection of CIN 2+ can be attributed to the fact that this test detects the expression of E6/E7 genes beyond a threshold from a limited number of oncogenic HPV types. In conclusion, Proofer is more specific than HC2 in identifying women with CIN 2+ but has a lower sensitivity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».