MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2109781002 · doi:10.1242/jcs.084624

<i>Arabidopsis</i> RHD3 mediates the generation of the tubular ER network and is required for Golgi distribution and motility in plant cells

2011· article· en· W2109781002 sur OpenAlexaff
Jun Chen, Giovanni Stefano, Federica Brandizzí, Huanquan Zheng

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGolgi apparatusBiologyArabidopsisEndoplasmic reticulumCell biologyGTPaseSecretory pathwayArabidopsis thalianaRoot hairMutantBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In plant cells, the endoplasmic reticulum (ER) and Golgi apparatus form a unique system in which single Golgi stacks are motile and in close association with the underlying ER tubules. Arabidopsis has three RHD3 (ROOT HAIR DEFECTIVE 3) isoforms that are analogous to the mammalian atlastin GTPases involved in shaping ER tubules. We used live-cell imaging, genetic complementation, split ubiquitin assays and western blot analyses in Arabidopsis and tobacco to show that RHD3 mediates the generation of the tubular ER network and is required for the distribution and motility of Golgi stacks in root and leaf epidermal cells. We established that RHD3 forms homotypic interactions at ER punctae. In addition, the activity of RHD3 on the tubular ER is specifically correlated with the cellular distribution and motility of Golgi stacks because ER to Golgi as well as Golgi to plasma membrane transport was not affected by RHD3 mutations in the conserved GDP/GTP motifs. We found a possible partial redundancy within the RHD3 isoforms in Arabidopsis. However, yeast Sey1p, a functional atlastin homologue, and RHD3 are not interchangeable in complementing the respective loss-of-function mutants, suggesting that the molecular mechanisms controlling ER tubular morphology might not be entirely conserved among eukaryotic lineages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations134
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Cell ScienceMême sujetCellular transport and secretionTravaux en français237 207