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The Somatic Genomic Landscape of Glioblastoma
Cameron Brennan, Roel G.W. Verhaak, Aaron McKenna, Benito Campos, Houtan Noushmehr, Sofie R. Salama, Siyuan Zheng, Debyani Chakravarty, Zack Sanborn, Samuel Berman, Rameen Beroukhim, Brady Bernard, Giannicola Genovese, Jill S. Barnholtz‐Sloan, Lihua Zou, Rahulsimham Vegesna, Sachet A. Shukla, Giovanni Ciriello, W. K. Alfred Yung, Wei Zhang, Carrie Sougnez, Tom Mikkelsen, Kenneth Aldape, Darell D. Bigner, Erwin G. Van Meir, Michael D. Prados, Andrew E. Sloan, Gaetano Finocchiaro, William A. Friedman, David W. Andrews, Abhijit Guha, Mary Iacocca, Brian Patrick O’Neill, Greg Foltz, Jerome Myers, Daniel J. Weisenberger, Robert Penny, Charles M. Perou, D. Neil Hayes, Richard A. Gibbs, Marco A. Marra, Gordon B. Mills, Eric S. Lander, Paul T. Spellman, Richard K. Wilson, John N. Weinstein, Stacey Gabriel, Peter W. Laird, David Haussler, Gad Getz, Lynda Chin, Christopher C. Benz, Wendi Barrett, Quinn T. Ostrom, Yingli Wolinsky, Bikash Bose, Paul T. Boulos, Madgy Boulos, Jenn Brown, Christine Czerinski, Matthew Eppley, Thelma Kempista, Teresa Kitko, Yakov Koyfman, Brenda Rabeno, Pawan Rastogi, Michael C. Sugarman, Patricia Swanson, Kennedy Yalamanchii, Ilana P. Otey, Yingchun Spring Liu, Yonghong Xiao, J. Todd Auman, Peng‐Chieh Chen, Angela Hadjipanayis, Eunjung Lee, Semin Lee, Peter J. Park, Jonathan G. Seidman, Lixing Yang, Steven N. Kalkanis, Laila Poisson, Aditya Raghunathan, Lisa Scarpace, Ryan Bressler, Andrea Eakin, Lisa Iype, Richard Kreisberg, Kalle Leinonen, Sheila M. Reynolds, Hector Rovira, Vésteinn Thórsson, Matti Annala, Joseph Paulauskis, Erin Curley, Martha Hatfield, David Mallery, Scott Morris, Troy Shelton, Candace Shelton, Mark E. Sherman, Peggy Yena, Lucia Cuppini, Francesco DiMeco, Marica Eoli, Emanuela Maderna, Bianca Pollo, Marco Saini, Saianand Balu, Katherine A. Hoadley, Ling Li, C. Ryan Miller, Yan Shi, Michael D. Topal, Junyuan Wu, Gavin P. Dunn, Caterina Giannini, Bülent Arman Aksoy, Yevgeniy Antipin, Laetitia Borsu, Ethan Cerami, Jianjiong Gao, Benjamin Groß, Marc Ladanyi, Alex Lash, Yupu Liang, Boris Reva, Nikolaus Schultz, Ronglai Shen, Nicholas D. Socci, Agnès Viale, Martin L. Ferguson, Qingrong Chen, John A. Demchok, Laura A. L. Dillon, Kenna Shaw, Margi Sheth, Roy Tarnuzzer, Liming Yang, Tanja M. Davidsen, Mark S. Guyer, Bradley A. Ozenberger, Heidi J. Sofia, Julie Bergsten, John Eckman, Jodi Harr, Christine Smith, Kelly J. Tucker, Cindy Winemiller, Leigh Anne Zach, Julia Y. Ljubimova, Greg Eley, Brenda Ayala, Mark A. Jensen, A Kahn, Todd Pihl, David Pot, Yunhu Wan, Nathan Hansen, Parvi Hothi, Biaoyang Lin, Nameeta Shah, Jae‐Geun Yoon, Ching C. Lau, Michael E. Berens, Kristin Ardlie, Scott L. Carter, Andrew D. Cherniack, Mike Noble, Juok Cho, Kristian Cibulskis, Daniel DiCara, Scott Frazer, Nils Gehlenborg, Jeff Gentry, David I. Heiman, Jaegil Kim, Rui Jing, Michael S. Lawrence, Pei Lin, Will Mallard, Robert C. Onofrio, Gordon Saksena, Steve Schumacher, Petar Stojanov, Barbara Tabak, Doug Voet, Hailei Zhang, Nathan N. Dees, Jun Li, Lucinda Fulton, Robert S. Fulton, Krishna-Latha Kanchi, Elaine R. Mardis, Stephen B. Baylin, Larry A. Harshyne, Mark L. Cohen, Karen Devine, Scott R. VandenBerg, Mitchel S. Berger, Brian Craft, Kyle Ellrott, Mary J. Goldman, Theodore C. Goldstein, Mia Grifford, Singer Ma, Sam Ng, Joshua M. Stuart, Teresa Swatloski, Peter Waltman, Jing Zhu, Robin M. Foss, Barbara Frentzen, Raquel G. McTiernan, Anthony T. Yachnis, Yong Mao, Rehan Akbani, Oliver Bögler, Gregory N. Fuller, Wenbin Liu, Yuexin Liu, Yiling Lu, Alexei Protopopov, Xiaojia Ren, Youting Sun, Jianhua Zhang, Ken Chen, Phillip H. Lai, Timothy J. Triche, David Van Den Berg, David H. Gutmann, Norman L. Lehman, Daniel J. Brat, Jeffrey J. Olson, Gena M. Mastrogianakis, Narra S. Devi, Zhaobin Zhang, Eric Lipp, Roger E. McLendon
Notice bibliographique
RevueCell · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensBC Cancer AgencyCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Human Genome Research InstituteHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologySomatic cellGlioblastomaGeneticsComputational biologyEvolutionary biologyCancer researchGene
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations5 161
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentnon