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Enregistrement W2109821644 · doi:10.1128/cdli.12.11.1292-1297.2005

Comparison of Lipopolysaccharide-Binding Functions of CD14 and MD-2

2005· article· en· W2109821644 sur OpenAlexaff
Jun Koraha, Naoko Tsuneyoshi, Masao Kimoto, Jean‐François Gauchat, Hiroshi Nakatake, Kenji Fukudome

Notice bibliographique

RevueClinical and Vaccine Immunology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRecombinant DNACD14LipopolysaccharideBiochemistryFusion proteinBinding proteinBiologyPlasma protein bindingBacterial outer membraneLipid AEscherichia coliBinding siteMyristoylationChemistryMolecular biologyReceptorMembraneImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prior to being recognized by the cell surface Toll-like receptor 4/MD-2 complex, lipopolysaccharide (LPS) in the bacterial outer membrane has to be processed by LPS-binding protein and CD14. CD14 forms a complex with monomeric LPS extracted by LPS-binding protein and transfers LPS to the cell surface signaling complex. In a previous study, we prepared a functional recombinant MD-2 using a bacterial expression system. We expressed the recombinant protein in Escherichia coli as a fusion protein with thioredoxin and demonstrated specific binding to LPS. In this study, we prepared recombinant CD14 fusion proteins using the same approach. Specific binding of LPS was demonstrated with a recombinant protein containing 151 amino-terminal residues. The region contained a hydrophilic region and the first three leucine-rich repeats (LRRs). The LRRs appeared to contribute to the binding because removal of the region resulted in a reduction in the binding function. LPS binding to the recombinant MD-2 was resistant to detergents. On the other hand, the binding to CD14 was prevented in the presence of low concentrations of detergents. In the case of human MD-2, the secondary myristoyl chain of LPS added by LpxM was required for the binding. A nonpathogenic penta-acyl LPS mutant lacking the myristoyl chain did not bind to MD-2 but did so normally to CD14. The broader LPS-binding spectrum of CD14 may allow recognition of multiple pathogens, and the lower affinity for LPS binding of CD14 allows transmission of captured materials to MD-2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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