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Enregistrement W2109845041 · doi:10.1099/mic.0.048140-0

Regulation of d-alanylation of lipoteichoic acid in Streptococcus gordonii

2011· article· en· W2109845041 sur OpenAlexafffund
Nicole E. McCormick, Scott A. Halperin, Fuping Song, Lee

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLipoteichoic acidStreptococcus gordoniilac operonMicrobiologyMutantBacteriaPolymyxinOperonBiologyBiofilmGene expressionPolymyxin BMolecular biologyChemistryStaphylococcus aureusBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

d-Alanyl esters on lipoteichoic acid (LTA) are involved in adhesion, biofilm formation, resistance to cationic antimicrobial peptides, and immune stimulation. There is evidence that bacteria can modulate the level of d-alanyl esters on LTA in response to challenge, but the mechanism of regulation appears to be different among bacteria. In this study, expression of the dlt operon responsible for d-alanylation of LTA was examined in the commensal bacterium Streptococcus gordonii. dlt expression was assessed using the dlt promoter-lacZ reporter gene assay, LTA d-alanine content measurements and dlt mRNA quantification. The results showed that dlt expression was growth phase-dependent, with the greatest expression at the mid-exponential phase of growth. In contrast to Staphylococcus aureus, dlt expression in Strep. gordonii was not affected by the exogenous addition of Mg(2+) or K(+). Interestingly, dlt expression was upregulated under acidic conditions or when cells were stressed with polymyxin B, indicating that cell envelope stress may be a signal for dlt expression. In view of these results, mutants defective in the cell envelope stress LiaSR two-component regulatory system were constructed. The liaS and liaR mutants showed an increase in dlt expression over the parent strain at neutral pH. The mutants failed to respond to low pH and polymyxin B stress; dlt expression remained the same in the presence or absence of these stresses. These results suggest that dlt expression in Strep. gordonii is regulated by the LiaSR regulatory system in response to environmental signals such as pH and polymyxin B. The regulation appears to be complex, involving both repression and activation mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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