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Enregistrement W2109935864 · doi:10.1074/jbc.275.6.3887

The Asp272–Glu282 Region of Platelet Glycoprotein Ibα Interacts with the Heparin-binding Site of α-Thrombin and Protects the Enzyme from the Heparin-catalyzed Inhibition by Antithrombin III

2000· article· en· W2109935864 sur OpenAlexafffund
Raimondo De Cristofaro, Erica De Candia, Sergio Rutella, Jeffrey I. Weitz

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésHeparinAntithrombinThrombinChemistryEnzymeBiochemistryGlycoproteinPlateletAntithrombinsMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Platelet glycoprotein Ib (GpIb) mediates interaction with both von Willebrand factor and thrombin. Thrombin binds to GpIb via its heparin-binding site (HBS) (De Candia, E., De Cristofaro, R., De Marco, L., Mazzucato, M., Picozzi, M., and Landolfi, R. (1997) Thromb. Haemostasis 77, 735-740; De Cristofaro, R., De Candia, E., Croce, G., Morosetti, R., and Landolfi, R. (1998) Biochem. J. 332, 643-650). To identify the thrombin-binding domain on GpIbalpha, we examined the effect of GpIbalpha(1-282), a GpIbalpha fragment released by the cobra venom mocarhagin on the heparin-catalyzed rate of thrombin inhibition by antithrombin III (AT). GpIbalpha(1-282) inhibited the reaction in a dose-dependent and competitive fashion. In contrast, the GpIbalpha(1-271) fragment, produced by exposing GpIbalpha(1-282) to carboxypeptidase Y, had no effect on thrombin inhibition by the heparin-AT complex. Measurements of the apparent equilibrium constant of the GpIbalpha(1-282) binding to thrombin as a function of different salts (NaCl and tetramethyl-ammonium chloride) concentration (0.1-0.2 M) indicated a large salt dependence (Gamma(+/-) = -4.5), similar to that pertaining to the heparin binding to thrombin. The importance of thrombin HBS in its interaction with GpIbalpha was confirmed using DNA aptamers, which specifically bind to either HBS (HD22) or the fibrinogen recognition site of thrombin (HD1). HD22, but not HD1, inhibited thrombin binding to GpIbalpha(1-282). Furthermore, the proteolytic derivative gamma(T)-thrombin, which lacks the fibrinogen recognition site, binds to GpIbalpha via its intact HBS in a reaction that is inhibited by HD22. Neither alpha- nor gamma(T)-thrombin bound to GpIbalpha(1-271), suggesting that the Asp(272)-Glu(282) region of GpIbalpha may act as a "heparin-like" ligand for the thrombin HBS, thereby inhibiting heparin binding to thrombin. It was also demonstrated that intact platelets may dose-dependently inhibit the heparin-catalyzed thrombin inhibition by AT at enzyme concentrations <5 nM. Altogether, these findings show that thrombin HBS binds to the region of GpIbalpha involving the Asp(272)-Glu(282) segment, protecting the enzyme from the inactivation by the heparin-AT system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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