The mitotic phosphorylation of p54<sup>nrb</sup> modulates its RNA binding activity
Notice bibliographique
Résumé
The RNA-binding protein p54(nrb) is involved in many nuclear processes including transcription, RNA processing, and retention of hyperedited RNAs. In interphase cells, p54(nrb) localizes to the nucleoplasm and concentrates with protein partners in the paraspeckles via an interaction with the non-coding RNA Neat1. During mitosis, p54(nrb) becomes multiphosphorylated and the effects of this modification are not known. In the present study, we show that p54(nrb) phosphorylation does not affect the interactions with its protein partners but rather diminishes its general RNA-binding ability. Biochemical assays indicate that in vitro phosphorylation of a GST-p54(nrb) construct by CDK1 abolishes the interaction with 5' splice site RNA sequence. Site-directed mutagenesis shows that the threonine 15 residue, located N-terminal to the RRM tandem domains of p54(nrb), is involved in this inhibition. In vivo analysis reveals that Neat1 ncRNA co-immunoprecipitates with p54(nrb) in either interphase or mitotic cells, suggesting that p54(nrb)-Neat1 interaction is not modulated by phosphorylation. Accordingly, in vitro phosphorylated GST-p54(nrb) still interacts with PIR-1 RNA, a G-rich Neat1 sequence known to interact with p54(nrb). In vitro RNA binding assays show that CDK1-phosphorylation of a GST-p54(nrb) construct abolishes its interaction with homoribopolymers poly(A), poly(C), and poly(U) but not with poly(G). These data suggest that p54(nrb) interaction with RNA could be selectively modulated by phosphorylation during mitosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».