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Enregistrement W2110033556 · doi:10.1074/jbc.m311064200

Purification and Characterization of a Barley Aleurone Abscisic Acid-binding Protein

2004· retraction· en· W2110033556 sur OpenAlexaff
Fawzi A. Razem, Ma Luo, Jinhao Liu, Suzanne R. Abrams, Robert D. Hill

Dossier post-publication

NatureRetraction
MotifFalsification/Fabrication of Data;Falsification/Fabrication of Image;Investigation by Company/Institution;Misconduct - Official Investigation(s) and/or Finding(s);Misconduct by Author;
Date2/5/2010 0:00
Signalé par OpenAlex ?Oui

Source : Retraction Watch, jointe par DOI. OpenAlex consigne la rétractation dans is_retracted, un booléen sur un espace d'états à au moins quatre valeurs ; il ne peut donc exprimer ni une expression de préoccupation, ni une correction, ni un rétablissement, et les rapporte comme false, ce qui se lit comme « rien à signaler ».

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typeretraction
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueToxin Mechanisms and Immunotoxins
Établissements canadiensPlant Biotechnology InstituteUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAbscisic acidAleuroneBiochemistryDissociation constantChemistryBinding proteinPolyclonal antibodiesColeoptileRecombinant DNABiologyGeneReceptorAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A protein designated ABAP1 and encoded by a novel gene (GenBank accession number AF127388) was purified and shown to specifically bind abscisic acid (ABA). ABAP1 protein is a 472-amino acid polypeptide containing a WW protein interaction domain and is induced by ABA in barley aleurone layers. Polyclonal antiidiotypic antibodies (AB2) cross-reacted with purified ABAP1 and with a corresponding 52-kDa protein associated with membrane fractions of ABA-treated barley aleurones. ABAP1 genes were detected in diverse monocot and dicot species, including wheat, tobacco, alfalfa, garden pea, and oilseed rape. The recombinant ABAP1 protein optimally bound (3)H-(+)-ABA at neutral pH. Denatured ABAP1 protein did not bind (3)H-(+)-ABA, nor did bovine serum albumin. The maximum specific binding as shown by Scatchard plot analysis was 0.8 mol of ABA mol(-1) protein with a linear function of r(2) = 0.94, an indication of one ABA-binding site with a dissociation constant (K(d)) of 28 x 10(-9) m. ABA binding in aleurone plasma membranes showed a maximum binding capacity of 330 nmol of ABA g(-1) protein with a K(d) of 26.5 x 10(-9) m. The similarities in the dissociation constants for ABA binding of the recombinant protein and that of the plasma membranes suggest that the protein within the plasma membrane fraction is the native form of ABAP1. The stereospecificity of ABAP1 was established by the incapability of ABA analogs and metabolites, including (-)-ABA, trans-ABA, phaseic acid, dihydrophaseic acid, and (+)-abscisic acid-glucose ester, to displace (3)H-(+)-ABA bound to ABAP1. However, two ABA precursors, (+)-ABA aldehyde and (+)-ABA alcohol, were able to displace (3)H-(+)-ABA, an indication that the structural requirement of ABAP1 at the C-1 position is not strict. Our data show that ABAP1 exerts high binding affinity for ABA. The interaction is reversible, follows saturation kinetics, and has stereospecificity, thus meeting the criteria for an ABA-binding protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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