MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2110281079 · doi:10.1099/00221287-147-11-3141

Binding to sulfatide and enterotoxicity of various Escherichia coli STb mutants

2001· article· en· W2110281079 sur OpenAlexaff
Vincent Labrie, Hans-Erick Beausoleil, J. Daniel Dubreuil, Josée Harel

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEscherichia coliMutantChemistryMutationBiochemistryBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Binding of the 48 amino acid polypeptide of the mature heat-stable Escherichia coli enterotoxin b (STb) to the functional receptor sulfatide (SFT) constitutes the first step in inducing secretory diarrhoea in the intestinal lumen of animals. The NMR structure of this toxin dictated the choice of amino acids for site-directed mutagenesis to delineate the binding site of STb to SFT. Amino acids facing the solvent either in the loop or the hydrophobic alpha-helix were selected. Seventeen site-specific mutants of STb toxin were produced and purified by high-pressure liquid chromatography. Enterotoxicity of the 17 mutants was determined using a rat loop assay and binding was evaluated using a microtitre plate binding assay. Both hydrophobic and electrostatic interactions are important for STb attachment. When mutations (F37K, I41S and M42S) were introduced into the hydrophobic alpha-helix to lessen hydrophobicity, binding activity and enterotoxicity decreased by more than sixfold. The loop defined by C21 and C36 also made specific contributions. Mutants generated at basic residues (K22, K23 and R29) within this region exhibited both reduced binding activities and reduced toxic activities. For all STb mutants constructed and analysed, when binding to SFT was reduced, a reduction in toxicity equivalent or greater was noted, indicating that binding to SFT is a step that precedes the toxic effect observed for STb toxin. Significantly, when the negatively charged D30 was substituted for either alanine or valine, the binding to SFT was about twice that of native STb, whereas the enterotoxicity was reduced by half.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,518

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMicrobiologyMême sujetAntibiotic Resistance in BacteriaTravaux en français237 207