MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2110300825 · doi:10.1242/jcs.120642

Plakoglobin interacts with the transcription factor p53 and regulates the expression of 14-3-3σ

2013· article· en· W2110300825 sur OpenAlexafffund
Zackie Aktary, Stephen C. Kulak, John R. Mackey, Nadia Jahroudi, Manijeh Pasdar

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématique14-3-3 protein interactions
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyTranscription factorPlakoglobinExpression (computer science)Cell biologyTranscription (linguistics)GeneticsComputational biologyEvolutionary biologyGeneCateninWnt signaling pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plakoglobin (γ-catenin), a constituent of the adherens junction and desmosomes, has signaling capabilities typically associated with tumor/metastasis suppression through mechanisms that remain undefined. To determine the role of plakoglobin during tumorigenesis and metastasis, we expressed plakoglobin in human tongue squamous cell carcinoma (SCC9) cells and compared the mRNA profiles of parental SCC9 cells and their plakoglobin-expressing transfectants (SCC9-PG). We detected several p53-target genes whose levels were altered upon plakoglobin expression. In this study, we identified the p53 regulated tumor suppressor 14-3-3σ as a direct plakoglobin-p53 target gene. Coimmunoprecipitation experiments revealed that plakoglobin and p53 interact, and chromatin immunoprecipitation and electrophoretic mobility shift assays revealed that plakoglobin and p53 associate with the 14-3-3σ promoter. Furthermore, luciferase reporter assays showed that p53 transcriptional activity is increased in the presence of plakoglobin. Finally, knockdown of plakoglobin in MCF-7 cells followed by luciferase assays confirmed that p53 transcriptional activity is enhanced in the presence of plakoglobin. Our data suggest that plakoglobin regulates gene expression in conjunction with p53 and that plakoglobin may regulate p53 transcriptional activity, which may account, in part, for the tumor/metastasis suppressor activity of plakoglobin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Cell ScienceMême sujet14-3-3 protein interactionsTravaux en français237 207