The 3′-untranslated region of the Ste20-like kinase SLK regulates SLK expression
Notice bibliographique
Résumé
Ste20-like kinase, SLK, a germinal center kinase found in kidney epithelial cells, signals to promote apoptosis. Expression of SLK mRNA and protein and kinase activity are increased during kidney development and recovery from ischemic acute renal failure. The 3'-untranslated region (3'-UTR) of SLK mRNA contains multiple adenine and uridine-rich elements, suggesting that 3'-UTR may regulate mRNA stability. This was confirmed in COS cell transient transfection studies, which showed that expression of the SLK open-reading frame plus 3'-UTR mRNA was reduced by 35% relative to the open-reading frame alone. To further characterize the SLK-3'-UTR, this nucleotide sequence was subcloned downstream of enhanced green fluorescent protein (EGFP) cDNA. In COS, 293T, and glomerular epithelial cells, expression of EGFP mRNA and protein was markedly reduced in the presence of the SLK-3'-UTR. After transfection and subsequent addition of actinomycin D, EGFP mRNA remained stable in cells for at least 6 h, whereas EGFP-SLK-3'-UTR mRNA decayed with a half-life of approximately 4 h. A region containing five AUUUA motifs within the SLK-3'-UTR destabilized EGFP mRNA. Deletion of this region from the SLK-3'-UTR, in part, restored mRNA stability. By UV cross-linking and SDS-PAGE, the SLK-3'-UTR bound to protein(s) of approximately 30 kDa in extracts of COS cells, glomerular epithelial cells, and kidney. Cotransfection of HuR (a RNA binding protein of approximately 30 kDa) increased the steady-state mRNA level of EGFP-SLK-3'-UTR but not EGFP. Thus the SLK-3'-UTR may interact with kidney RNA-binding proteins to regulate expression of SLK mRNA during kidney development and after ischemic injury.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».