SCUTICOCILIATE ENDOSYMBIONTS OF ECHINOIDS (PHYLUM ECHINODERMATA): PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS AMONG SPECIES IN THE GENERA ENTODISCUS, PLAGIOPYLIELLA, THYROPHYLAX, AND ENTORHIPIDIUM (PHYLUM CILIOPHORA)
Notice bibliographique
Résumé
Morphological research on over 50 species of ciliates recorded as endosymbionts of echinoids suggests that invasion of the echinoid microhabitat occurred on at least 4 occasions. Gene sequence data confirm the phylogenetic distinctness of spirotrichean, armophorean, plagiopylean, and oligohymenophorean endosymbionts. It is also likely that oligohymenophoreans have repeatedly invaded the gut habitat. To test this hypothesis, we sequenced small subunit rRNA (SSrRNA) genes of 6 species representing the larger scuticociliate species found in the intestine of Strongylocentrotus pallidus from the northeast Pacific Ocean: Entodiscus borealis (Entodiscidae); Plagiopyliella pacifica and Thyrophylax vorax (Thyrophylacidae); and Entorhipidium pilatum, Entorhipidium tenue, and Entorhipidium sp. (Entorhipidiidae). SsrRNA genes were amplified by PCR, and sequences obtained in both directions. In all phylogenetic analyses, the scuticociliates are well supported as a clade. Entodiscus is distinct from these other echinoid taxa and is the sister taxon to the facultatively parasitic Uronema marinum. The other 5 echinoid species always form a clade whose basal species is the free-living Parauronema longum. The greatest genetic distance among these latter 5 species is less than 1.5%. This probably explains why the Thyrophylacidae and Entorhipidiidae are paraphyletic based on the SSrRNA gene sequences.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».