Identification of the gene responsible for the cblB complementation group of vitamin B12-dependent methylmalonic aciduria
Notice bibliographique
Résumé
The methylmalonic acidurias are metabolic disorders resulting from deficient methylmalonyl-CoA mutase activity, a vitamin B(12)-dependent enzyme. We have cloned the gene for the cblB complementation group caused by deficient activity of a cob(I)alamin adenosyltransferase. This was accomplished by searching bacterial genomes for genes in close proximity to the methylmalonyl-CoA mutase gene that might encode a protein with the properties of an adenosyltransferase. A candidate was identified in the Archaeoglobus fulgidus genome and was used to probe the human genome database. It yielded a gene on chromosome 12q24 that encodes a predicted protein of 250 amino acids with 45% similarity to PduO in Salmonella enterica, a characterized cob(I)alamin adenosyltransferase. A northern blot revealed an RNA species of 1.1 kb predominating in liver and skeletal muscle. The gene was evaluated for deleterious mutations in cblB patient cell lines. Several mutations were identified including a 5 bp deletion (5del572gggcc576), two splice site mutations (IVS2-1G>T, IVS3-1G>A), andt several point mutations (A135T, R186W, R191W and E193K). Two additional amino acid substitutions (R19Q and M239K) were found in several patient cell lines but were found to be common polymorphisms (36% and 46%) in control alleles. The R186W mutation, which we suggest is disease-linked, is present in four of the six patient cell lines examined (homoallelic in two) and in 4 of 240 alleles in control samples. These data confirm that the identified gene, MMAB, corresponds to the cblB complementation group and has the appearance of a cob(I)alamin adenosyltransferase, as predicted from biochemical data.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».