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Enregistrement W2110499037 · doi:10.1242/jcs.02394

Telomeres: what's new at your end?

2005· review· en· W2110499037 sur OpenAlexaff
Catherine LeBel, Raymund J. Wellinger

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2005
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTelomereEvolutionary biologyGeneticsComputational biologyDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ends of linear eukaryotic chromosomes, the telomeres, fulfill unique and essential functions in genome integrity. First and above all, they represent the ends of the DNA molecules. In general, non-telomeric double-strand DNA breaks (DSBs) are not tolerated and are rapidly repaired. This scenario, however, does not apply to telomeres (Muller, 1938; McClintock, 1939). Indeed, telomeric chromosome ends are bound by a complex cast of factors that protect chromosome ends from degradation or fusion (d’Adda di Fagagna et al., 2004). Second, owing to the semi-conservative synthesis of DNA, a DNA end cannot be completely duplicated (Watson, 1972; Olovnikov, 1973). To avoid continuous sequence loss from the telomeres in dividing cells, special mechanisms have evolved. In most eukaryotic organisms, the solution to the problem involves a ribonuclear complex, called telomerase, that is minimally composed of a reverse transcriptase catalytic protein subunit and an RNA subunit that is used as the template (Greider and Blackburn, 1987). In order to accommodate these two functions, the overall telomere structure is dynamic and undergoes dramatic changes during the cell cycle particularly in S phase (Blackburn, 2001; Vega et al., 2003; Smogorzewska and de Lange, 2004). Telomere structure and function have been most intensely studied in model systems such as budding yeast and in human cell lines. Therefore, we chose these organisms to illustrate similarities and differences in telomere composition and structure. Telomeric DNA structures are highly conserved amongst eukaryotes. In virtually all organisms, chromosomes end with an array of short direct repeats. For example, human telomeres comprise 2-20 kb of (TTAGGG)n repeats. The species-specific repeats are related to each other, each being composed of a G-rich and a C-rich strand. Moreover, the directionality of the repeats is conserved

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0050,010
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0050,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,377
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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