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Enregistrement W2110505696 · doi:10.1242/jcs.00039

Evidence for a role for the <i>Dictyostelium</i> Rap1 in cell viability and the response to osmotic stress

2002· article· en· W2110505696 sur OpenAlexaff
Rujun Kang, Helmut Kae, Hermia Ip, George B. Spiegelman, Gerald Weeks

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRap1BiologyCell biologyGene expressionOsmotic shockMolecular biologyGeneBiochemistrySignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Dictyostelium genome contains a single rapA gene, which encodes a Rap1 monomeric G protein. As attempts at generating rapA-null Dictyostelium cells had been unsuccessful, expression of antisense RNA from the rapA gene under control of the folate repressible discoidin promoter was used to reduce cellular levels of the Rap1 protein. As Rap1 levels gradually decreased following antisense rapA RNA induction, growth rate and cell viability also decreased, a result consistent with the idea that rapA is an essential gene. The Rap1-depleted cells exhibited reduced viability in response to osmotic shock. The accumulation of cGMP in response to 0.4 M sorbitol was reduced after rapA antisense RNA induction and was enhanced in cells expressing the constitutively activated Rap1(G12V) protein, suggesting a role for Rap1 in the generation of cGMP. Dictyostelium Rap1 formed a complex with the Ras-binding domain of RalGDS only when it was in a GTP-bound state. This assay was used to demonstrate that activation of Rap1 in response to 0.4 M sorbitol occurred with initial kinetics similar to those observed for the accumulation of cGMP. Furthermore, the addition of 2 mM EDTA to osmotically shocked cells, a treatment that enhances cGMP accumulation, also enhanced Rap1 activation. These results suggest a direct role for Rap1 in the activation of guanylyl cyclase during the response to hyperosmotic conditions. Rap1 was also activated in response to low temperature but not in response to low osmolarity or high temperature.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,146

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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