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Enregistrement W2110514596 · doi:10.4141/cjps2013-154

Identification of regulatory genes to improve nitrogen use efficiency

2014· article· en· W2110514596 sur OpenAlexaffvenue
David Guevara, Yong‐Mei Bi, Steven J. Rothstein

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant nutrient uptake and metabolism
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneXylemBiologyGenetically modified cropsTransgeneNitrogenCropGene expressionAgronomyBiotechnologyBotanyGeneticsChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Guevara, D. R., Bi, Y.-M. and Rothstein, S. J. 2014. Identification of regulatory genes to improve nitrogen use efficiency. Can. J. Plant Sci. 94: 1009–1012. Crop production on soils containing sub-optimal levels of nitrogen (N) severely compromises yield potential. The development of crop varieties displaying high N use efficiency (NUE) is necessary in order to optimize N fertilizer use, and reduce the environmental damage caused by the current excessive application of N in agricultural areas. Genome-wide microarray analysis of rice plants grown under N-limiting environments was performed to identify NUE candidate genes. An early nodulin gene, OsENOD93-1, was strongly up-regulated during plant growth under low N. A constitutive Ubiquitin promoter was used to drive the expression of the OsENOD93-1 gene in transgenic plants to determine the importance of OsENOD93-1 for rice NUE. Transgenic rice plants over-expressing the OsENOD93-1 gene achieved ∼23% and 16% more yield and biomass, respectively, compared with wild-type plants when grown under N-limitation conditions. OsENOD93-1-OX transgenic plants accumulated a higher amount of total amino acids in the roots and xylem sap under N stress, suggesting that OsENOD93-1 plays a role in the transportation of amino acids. Taken together, we demonstrate that an effective way to identify NUE gene candidates involves both transcriptional profiling coupled with a transgenic validation approach to improve complex traits such as NUE in important crops.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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