Identification and Molecular Characterization of the Chromosomal Exopolysaccharide Biosynthesis Gene Cluster from <i>Lactococcus lactis</i> subsp. <i>cremoris</i> SMQ-461
Notice bibliographique
Résumé
The exopolysaccharide (EPS) capsule-forming strain SMQ-461 of Lactococcus lactis subsp. cremoris, isolated from raw milk, produces EPS with an apparent molecular mass of >1.6 x 10(6) Da. The EPS biosynthetic genes are located on the chromosome in a 13.2-kb region consisting of 15 open reading frames. This region is flanked by three IS1077-related tnp genes (L. lactis) at the 5' end and orfY, along with an IS981-related tnp gene, at the 3' end. The eps genes are organized in specific regions involved in regulation, chain length determination, biosynthesis of the repeat unit, polymerization, and export. Three (epsGIK) of the six predicted glycosyltransferase gene products showed low amino acid similarity with known glycosyltransferases. The structure of the repeat unit could thus be different from those known to date for Lactococcus. Reverse transcription-PCR analysis revealed that the eps locus is transcribed as a single mRNA. The function of the eps gene cluster was confirmed by disrupting the priming glycosyltransferase gene (epsD) in Lactococcus cremoris SMQ-461, generating non-EPS-producing reversible mutants. This is the first report of a chromosomal location for EPS genetic elements in Lactococcus cremoris, with novel glycosyltransferases not encountered before in lactic acid bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».