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Enregistrement W2110613006 · doi:10.1093/nar/gkm1162

Lsr2 of Mycobacterium tuberculosis is a DNA-bridging protein

2008· article· en· W2110613006 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyNucleoidDNAMutantGeneticsDNA-binding proteinMycobacterium tuberculosisGeneCell biologyDNA gyraseMicrobiologyEscherichia coliTuberculosisTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lsr2 is a small, basic protein present in Mycobacterium and related actinomycetes. Recent studies suggest that Lsr2 is a regulatory protein involved in multiple cellular processes including cell wall biosynthesis and antibiotic resistance. However, the underlying molecular mechanisms remain unknown. In this article, we performed biochemical studies of Lsr2-DNA interactions and structure-function analysis of Lsr2. Analysis by atomic force microscopy revealed that Lsr2 has the ability to bridge distant DNA segments, suggesting that Lsr2 plays a role in the overall organization and compactness of the nucleoid. Mutational analysis identified critical residues and selection of dominant negative mutants demonstrated that both DNA binding and protein oligomerization are essential for the normal functions of Lsr2 in vivo. These results provide strong evidence that Lsr2 is a DNA bridging protein, which represents the first identification of such proteins in bacteria phylogenetically distant from the Enterobacteriaceae. DNA bridging by Lsr2 also provides a mechanism of transcriptional regulation by Lsr2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,252
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle