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Enregistrement W2110634923 · doi:10.1186/1476-072x-10-54

Adjusting for sampling variability in sparse data: geostatistical approaches to disease mapping

2011· article· en· W2110634923 sur OpenAlexaff
Kristen H. Hampton, Marc L. Serre, Dionne Gesink, Christopher D. Pilcher, William C. Miller

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Health Geographics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Mental HealthNorth Carolina Department of Health and Human ServicesU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésSmoothingKrigingEstimatorSpatial analysisPoisson distributionStatisticsAutocorrelationGeostatisticsComputer scienceBayesian probabilitySampling (signal processing)Spatial correlationMathematicsData miningSpatial variability

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Disease maps of crude rates from routinely collected health data indexed at a small geographical resolution pose specific statistical problems due to the sparse nature of the data. Spatial smoothers allow areas to borrow strength from neighboring regions to produce a more stable estimate of the areal value. Geostatistical smoothers are able to quantify the uncertainty in smoothed rate estimates without a high computational burden. In this paper, we introduce a uniform model extension of Bayesian Maximum Entropy (UMBME) and compare its performance to that of Poisson kriging in measures of smoothing strength and estimation accuracy as applied to simulated data and the real data example of HIV infection in North Carolina. The aim is to produce more reliable maps of disease rates in small areas to improve identification of spatial trends at the local level. RESULTS: In all data environments, Poisson kriging exhibited greater smoothing strength than UMBME. With the simulated data where the true latent rate of infection was known, Poisson kriging resulted in greater estimation accuracy with data that displayed low spatial autocorrelation, while UMBME provided more accurate estimators with data that displayed higher spatial autocorrelation. With the HIV data, UMBME performed slightly better than Poisson kriging in cross-validatory predictive checks, with both models performing better than the observed data model with no smoothing. CONCLUSIONS: Smoothing methods have different advantages depending upon both internal model assumptions that affect smoothing strength and external data environments, such as spatial correlation of the observed data. Further model comparisons in different data environments are required to provide public health practitioners with guidelines needed in choosing the most appropriate smoothing method for their particular health dataset.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,607
Score d'incertitude au seuil0,598

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,563
Tête enseignante GPT0,412
Écart entre enseignants0,152 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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