A comparative structure-function analysis of active-site inhibitors of<i>Vibrio cholerae</i>cholix toxin
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Cholix toxin from Vibrio cholerae is a novel mono-ADP-ribosyltransferase (mART) toxin that shares structural and functional properties with Pseudomonas aeruginosa exotoxin A and Corynebacterium diphtheriae diphtheria toxin. Herein, we have used the high-resolution X-ray structure of full-length cholix toxin in the apo form, NAD(+) bound, and 10 structures of the cholix catalytic domain (C-domain) complexed with several strong inhibitors of toxin enzyme activity (NAP, PJ34, and the P-series) to study the binding mode of the ligands. A pharmacophore model based on the active pose of NAD(+) was compared with the active conformation of the inhibitors, which revealed a cationic feature in the side chain of the inhibitors that may determine the active pose. Moreover, a conformational search was conducted for the missing coordinates of one of the main active-site loops (R-loop). The resulting structural models were used to evaluate the interaction energies and for 3D-QSAR modeling. Implications for a rational drug design approach for mART toxins were derived.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle