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Enregistrement W2110746103 · doi:10.1136/jmg.2004.024075

Linkage to the <i>FOXC2</i> region of chromosome 16 for varicose veins in otherwise healthy, unselected sibling pairs

2005· article· en· W2110746103 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiagnosis and Treatment of Venous Diseases
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésConcordanceLocus (genetics)Genetic linkageGeneticsConfidence intervalPopulationDizygotic twinVaricose veinsSiblingLinkage (software)MedicineBiologyTwin studyHeritabilityInternal medicineGeneSurgeryPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The FOXC2 gene on 16q24 is mutated in lymphoedema distichiasis (LD), in which varicose veins (VV) are a common feature. We hypothesised that this gene might be implicated in the development of VV in the normal population, therefore, after performing a classical twin study, we tested for linkage and association in white women. We also tested for linkage with haemorrhoids (H), as a separate venous anomaly at the same locus. METHODS: A total of 2060 complete female twin pairs aged 18-80 years from the St Thomas' Adult UK Twin registry replied to questions on VV and H as part of a broader postal survey of 6600 twins (62% response rate). Dizygotic female twin pairs were tested for linkage and association to the candidate marker D16S520 (1903 individuals genotyped), which is located about 80 kb from FOXC2. RESULTS: Casewise concordance rates were significantly higher for monozygotic than dizygotic twins for both phenotypes (VV 67% v 45%; p = 2.2x10(-6); H 68% v 59%; p = 0.01; H including during pregnancy 73% v 64%; p = 2.1x10(-4)), corresponding to additive genetic heritabilities in liability of 86% (95% confidence interval (CI) 73% to 99%) for VV and 56-61% for H (95% CI 43% to 73%). The presence of VV and H were significantly correlated. We found significant evidence of linkage to the marker for VV (MLS(ASP) = 1.37, p = 0.01; GLM(ASP/DSP) Z = 3.17 p = 0.002), but no association. Both linkage and association tests were negative for H. The combined phenotype of having VV and H did not show any evidence of linkage or association. CONCLUSION: These results demonstrate VV and H to be heritable, related conditions, and the data strongly suggest FOXC2 to be implicated in the development of VV in the general population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,710
Score d'incertitude au seuil0,310

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle