MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2110748437 · doi:10.1128/jcm.43.7.3213-3220.2005

Characterization of a Shiga Toxin-, Intimin-, and Enterotoxin Hemolysin-Producing <i>Escherichia coli</i> ONT:H25 Strain Commonly Isolated from Healthy Cattle

2005· article· en· W2110748437 sur OpenAlexaboutno aff
Haiqing Sheng, Margaret A. Davis, Hannah J. Knecht, Dale D. Hancock, Joyce Van Donkersgoed, Carolyn J. Hovde

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthIdaho Beef CouncilEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentU.S. Department of Agriculture
Mots-clésIntiminMicrobiologyEscherichia coliHemolysinShiga-like toxinShiga toxinEnterotoxinStrain (injury)BiologyToxinEnterobacteriaceaeHeat-stable enterotoxinBacteriaVirulenceGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Among bovine fecal and recto-anal mucosal swab samples cultured in our laboratory for Escherichia coli O157:H7, we frequently isolated E. coli organisms that were phenotypically similar to the O157:H7 serotype as non-sorbitol fermenting and negative for beta-glucuronidase activity but serotyped O nontypeable:H25 (ONT:H25). This study determined the prevalence and virulence properties of the E. coli ONT:H25 isolates. Among dairy and feedlot cattle (n = 170) sampled in Washington, Idaho, and Alberta, Canada, the percentage of animals culture positive for E. coli ONT:H25 ranged from 7.5% to 22.5%, compared to the prevalence of E. coli O157:H7 that ranged from 0% to 15%. A longitudinal 8-month study of dairy heifers (n = 40) showed that 0 to 15% of the heifers were culture positive for E. coli O157:H7, while 15 to 22.5% of the animals were culture positive for E. coli ONT:H25. As determined by a multiplex PCR, the E. coli ONT:H25 isolates carried a combination of virulence genes characteristic of the enterohemorrhagic E. coli, including intimin, translocated intimin receptor, Stx2, and hemolysin (eae-beta, tir, stx(2vh-a), and hly). E. coli ONT:H25 isolates from diverse geographic locations and over time were fingerprinted by separating XbaI-restricted chromosomal DNA by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) separation. Two strains of E. coli ONT:H25 were highly similar by PFGE pattern. Experimental inoculation of cattle showed that E. coli ONT:H25, like E. coli O157:H7, colonized the bovine recto-anal junction mucosa for more than 4 weeks following a single rectal application of bacteria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,041

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical MicrobiologyMême sujetEscherichia coli research studiesTravaux en français237 207