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Enregistrement W2110774612 · doi:10.1097/lgt.0b013e3181f6c84d

Association of Elevated E6 Oncoprotein With Grade of Cervical Neoplasia Using PDZ Interaction-Mediated Precipitation of E6

2011· article· en· W2110774612 sur OpenAlexaff
John W. Sellors, Johannes Schweizer, Peter S. Lu, Bin Liu, Bernhard H. Weigl, Jian Feng Cui, Roger Peck, Kristen Lewis, Jeanette Lim, Michelle Howard, Charles Mahoney, Linda McAllister, Marthe Berard‐Bergery, Claire Bry, Yassine A. Labiad, Haimin Li, Lilyn Liu, Jon Silver, Wen Chen, You‐Lin Qiao

Notice bibliographique

RevueJournal of Lower Genital Tract Disease · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Cancer Institute
Mots-clésColposcopyMedicineCervical intraepithelial neoplasiaEndocervical curettageOdds ratioCervical cancerBiopsyCytologyGynecologyInternal medicineGastroenterologyOncologyPathologyCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To determine the expression of human papillomavirus (HPV) type 16 E6 oncoprotein in cervical specimens of women with and without cervical intraepithelial neoplasia (CIN). MATERIALS AND METHODS: Cervical specimens from 2,530 unscreened women aged 30 to 54 years from Shanxi, China, were obtained. All women were assessed by liquid-based cytology, high-risk HPV DNA tests, and colposcopy with directed biopsy and endocervical curettage as necessary. Women with abnormal cytologic results or positive HPV DNA results were recalled for colposcopy, 4-quadrant cervical biopsies, and endocervical curettage. Women with biopsy-proven CIN and cancer and a convenience sample of HC2-positive, disease-negative women were tested for the presence of HPV-16 infection via HPV-16 E6 DNA-specific polymerase chain reaction. A PDZ interaction-mediated E6 oncoprotein precipitation method followed by E6-specific Western blot was performed on specimens from women with HPV-16 infections. Associations between elevated expression of E6 oncoprotein and CIN 2 and 3 were determined using logistic regression and a reference category of CIN 1 and disease-negative. RESULTS: A significant trend for the detection of HPV-16 E6 oncoprotein in specimen of women with proven HPV-16 infection was determined: 0% (0/12), 12.5% (1/8), 36.4% (4/11), and 42.9% (3/7) of those with negative findings, CIN 1, 2, and 3, respectively (p = .01). Compared with the category combining negative findings and CIN 1, detection of E6 oncoprotein was associated with CIN 2 (odds ratio = 10.9, p = .05) and CIN 3 (odds ratio = 14.3, p = .04). CONCLUSIONS: There is a significant association between elevated expression of E6 oncoprotein and grade of CIN. This finding seems consistent with the role played by E6 oncoprotein in carcinogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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