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Enregistrement W2110793265 · doi:10.1186/gb-2013-14-12-r141

Obligate mutualism within a host drives the extreme specialization of a fig wasp genome

2013· article· en· W2110793265 sur OpenAlexafffund
Jinhua Xiao, Zhen Yue, Ling-Yi Jia, Xinhua Yang, Lihua Niu, Zhuo Wang, Peng Zhang, Baofa Sun, Shunmin He, Zi Li, Tuanlin Xiong, Xin Wen, Haifeng Gu, Bo Wang, John H. Werren, Robert W. Murphy, David A. Wheeler, Li‐Ming Niu, Guang‐Chang Ma, Ting Tang, Sheng‐Nan Bian, Ningxin Wang, Chunyan Yang, Nan Wang, Yueguan Fu, Wenzhu Li, Soojin V. Yi, Xingyu Yang, Qing Zhou, Changxin Lu, Chunyan Xu, Lijuan He, Lili Yu, Ming Chen, Shaowei Wang, Shuang Zhao, Yanhong Li, Yangyang Yu, Xiaoju Qian, Yue Cai, Lianle Bian, Shu Zhang, Junyi Wang, Ye Yin, Hui Xiao, Guan-Hong Wang, Hui Yu, Wen-Shan Wu, James M. Cook, Jun Wang, Da‐Wei Huang

Notice bibliographique

RevueGenome biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesChinese Academy of SciencesInstitute of Zoology, Chinese Academy of SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyObligateMutualism (biology)Evolutionary biologyGenomeGenome BiologyHuman geneticsGeneticsGeneGenomicsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Fig pollinating wasps form obligate symbioses with their fig hosts. This mutualism arose approximately 75 million years ago. Unlike many other intimate symbioses, which involve vertical transmission of symbionts to host offspring, female fig wasps fly great distances to transfer horizontally between hosts. In contrast, male wasps are wingless and cannot disperse. Symbionts that keep intimate contact with their hosts often show genome reduction, but it is not clear if the wide dispersal of female fig wasps will counteract this general tendency. We sequenced the genome of the fig wasp Ceratosolen solmsi to address this question. RESULTS: The genome size of the fig wasp C. solmsi is typical of insects, but has undergone dramatic reductions of gene families involved in environmental sensing and detoxification. The streamlined chemosensory ability reflects the overwhelming importance of females finding trees of their only host species, Ficus hispida, during their fleeting adult lives. Despite long-distance dispersal, little need exists for detoxification or environmental protection because fig wasps spend nearly all of their lives inside a largely benign host. Analyses of transcriptomes in females and males at four key life stages reveal that the extreme anatomical sexual dimorphism of fig wasps may result from a strong bias in sex-differential gene expression. CONCLUSIONS: Our comparison of the C. solmsi genome with other insects provides new insights into the evolution of obligate mutualism. The draft genome of the fig wasp, and transcriptomic comparisons between both sexes at four different life stages, provide insights into the molecular basis for the extreme anatomical sexual dimorphism of this species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,989
Score d'incertitude au seuil0,837

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,143 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations106
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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