Divergent Targets of Aspergillus fumigatus AcuK and AcuM Transcription Factors during Growth <i>In Vitro</i> versus Invasive Disease
Notice bibliographique
Résumé
In Aspergillus nidulans, the AcuK and AcuM transcription factors form a complex that regulates gluconeogenesis. In Aspergillus fumigatus, AcuM governs gluconeogenesis and iron acquisition in vitro and virulence in immunosuppressed mice. However, the function of AcuK was previously unknown. Through in vitro studies, we found that A. fumigatus ΔacuK single and ΔacuK ΔacuM double mutants had impaired gluconeogenesis and iron acquisition, similar to the ΔacuM mutant. Also, the ΔacuK, ΔacuM, and ΔacuK ΔacuM mutants had similar virulence defects in mice. However, the ΔacuK mutant had a milder defect in extracellular siderophore activity and induction of epithelial cell damage in vitro than did the ΔacuM mutant. Moreover, overexpression of acuM in the ΔacuK mutant altered expression of 3 genes and partially restored growth under iron-limited conditions, suggesting that AcuM can govern some genes independently of AcuK. Although the ΔacuK and ΔacuM mutants had very similar transcriptional profiles in vitro, their transcriptional profiles during murine pulmonary infection differed both from their in vitro profiles and from each other. While AcuK and AcuM governed the expression of only a few iron-responsive genes in vivo, they influenced the expression of other virulence-related genes, such as hexA and dvrA. Therefore, in A. fumigatus, while AcuK and AcuM likely function as part of the same complex, they can also function independently of each other. Furthermore, AcuK and AcuM have different target genes in vivo than in vitro, suggesting that in vivo infection stimulates unique transcriptional regulatory pathways in A. fumigatus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».