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Enregistrement W2110966542 · doi:10.1074/jbc.m110.199737

Potent and Selective Inhibitors of the Inositol-requiring Enzyme 1 Endoribonuclease

2011· article· en· W2110966542 sur OpenAlexaff
Kori Volkmann, Julie L. Lucas, D Vuga, Xiaoping Wang, Duane Brumm, Caryn Stiles, David Kriebel, Ani Der-Sarkissian, K Navaneeth Krishnan, Colleen Schweitzer, Zheng Liu, Uriel M. Malyankar, David Chiovitti, Marella D. Canny, Daniel Durocher, Frank Sicheri, John B. Patterson

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesMultiple Myeloma Research Foundation
Mots-clésEndoribonucleaseEndoplasmic reticulumRNA splicingBiochemistryUnfolded protein responseRNABiologyRNase PChemistryCell biologyMolecular biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Inositol-requiring enzyme 1 (IRE1) is the most highly conserved signaling node of the unfolded protein response (UPR) and represents a potential therapeutic target for a number of diseases associated with endoplasmic reticulum stress. IRE1 activates the XBP-1 transcription factor by site-specific cleavage of two hairpin loops within its mRNA to facilitate its nonconventional splicing and alternative translation. We screened for inhibitors using a construct containing the unique cytosolic kinase and endoribonuclease domains of human IRE1α (hIRE1α-cyto) and a mini-XBP-1 stem-loop RNA as the substrate. One class compounds was salicylaldehyde analogs from the hydrolyzed product of salicylaldimines in the library. Salicylaldehyde analogs were active in inhibiting the site-specific cleavage of several mini-XBP-1 stem-loop RNAs in a dose-dependent manner. Salicyaldehyde analogs were also active in inhibiting yeast Ire1 but had little activity inhibiting RNase L or the unrelated RNases A and T1. Kinetic analysis revealed that one potent salicylaldehyde analog, 3-ethoxy-5,6-dibromosalicylaldehyde, is a non-competitive inhibitor with respect to the XBP-1 RNA substrate. Surface plasmon resonance studies confirmed this compound bound to IRE1 in a specific, reversible and dose-dependent manner. Salicylaldehydes inhibited XBP-1 splicing induced pharmacologically in human cells. These compounds also blocked transcriptional up-regulation of known XBP-1 targets as well as mRNAs targeted for degradation by IRE1. Finally, the salicylaldehyde analog 3-methoxy-6-bromosalicylaldehyde strongly inhibited XBP-1 splicing in an in vivo model of acute endoplasmic reticulum stress. To our knowledge, salicylaldehyde analogs are the first reported specific IRE1 endoribonuclease inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations211
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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