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Enregistrement W2111106407 · doi:10.1371/journal.pgen.1002159

Transportin-SR Is Required for Proper Splicing of Resistance Genes and Plant Immunity

2011· article· en· W2111106407 sur OpenAlexafffund
Shaohua Xu, Zhibin Zhang, Beibei Jing, Patrick J. Gannon, Jinmei Ding, Fang Xu, Xin Li, Yuelin Zhang

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMinistry of Science and Technology of the People's Republic of China
Mots-clésBiologyRNA splicingSR proteinCell biologyNuclear transportGeneticsGeneNuclear localization sequenceCloning (programming)ImportinPositional cloningRNA-binding proteinRNACell nucleusMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transportin-SR (TRN-SR) is a member of the importin-β super-family that functions as the nuclear import receptor for serine-arginine rich (SR) proteins, which play diverse roles in RNA metabolism. Here we report the identification and cloning of mos14 (modifier of snc1-1, 14), a mutation that suppresses the immune responses conditioned by the auto-activated Resistance (R) protein snc1 (suppressor of npr1-1, constitutive 1). MOS14 encodes a nuclear protein with high similarity to previously characterized TRN-SR proteins in animals. Yeast two-hybrid assays showed that MOS14 interacts with AtRAN1 via its N-terminus and SR proteins via its C-terminus. In mos14-1, localization of several SR proteins to the nucleus was impaired, confirming that MOS14 functions as a TRN-SR. The mos14-1 mutation results in altered splicing patterns of SNC1 and another R gene RPS4 and compromised resistance mediated by snc1 and RPS4, suggesting that nuclear import of SR proteins by MOS14 is required for proper splicing of these two R genes and is important for their functions in plant immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,394

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations104
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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