Divergent transcriptomic responses to repeated and single cold exposures in <i>Drosophila melanogaster</i>
Notice bibliographique
Résumé
Insects in the field are exposed to multiple bouts of cold, and there is increasing evidence that the fitness consequences of repeated cold exposure differ from the impacts of a single cold exposure. We tested the hypothesis that different kinds of cold exposure (in this case, single short, prolonged and repeated cold exposure) would result in differential gene expression. We exposed 3 day old adult female wild-type Drosophila melanogaster (Diptera: Drosophilidae) to -0.5°C for a single 2 h exposure, a single 10 h exposure, or five 2 h exposures on consecutive days, and extracted RNA after 6 h of recovery. Global gene expression was quantified using an oligonucleotide microarray and validated with real-time PCR using different biological replicates. We identified 76 genes upregulated in response to multiple cold exposure, 69 in response to prolonged cold exposure and 20 genes upregulated in response to a single short cold exposure, with a small amount of overlap between treatments. Three genes--Turandot A, Hephaestus and CG11374--were upregulated in response to all three cold exposure treatments. Key functional groups upregulated include genes associated with muscle structure and function, the immune response, stress response, carbohydrate metabolism and egg production. We conclude that cold exposure has wide-ranging effects on gene expression in D. melanogaster and that increased duration or frequency of cold exposure has impacts different to those of a single short cold exposure. This has important implications for extrapolating laboratory studies of insect overwintering that are based on only a single cold exposure.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».