PHYLOGEOGRAPHY OF THE PLAINS KILLIFISH, FUNDULUS ZEBRINUS
Notice bibliographique
Résumé
Drainage systems of the Great Plains and western Gulf Slope underwent substantial changes through diversions and stream captures during the Pleistocene, either as the result of the glacial advances or through independent geologic processes. The distributions of a variety of fishes that range across west-central North America, such as the plains killifish (Fundulus zebrinus), are thought to be the product of this Pleistocene influence. We examined the geographic pattern of genetic variation in F. zebrinus using three allozyme loci (n = 793), mitochondrial DNA restriction fragment length polymorphisms (RFLPs, n = 352), and sequencing of the mitochondrial cytochrome oxidase I (COI, n = 23) in an attempt to understand the roles of dispersal and vicariance. The phylogeographic patterns were concordant between the allozyme and mitochondrial data with the exception of the population in the North Canadian River. The populations fell into three geographic assemblages, which we designated as northern, central, and southern. A large phylogenetic break (average Roger's D = 0.702; average sequence divergence in RFLPs = 4.6%; average sequence divergence in COI = 5.5%) separated the northern/central and southern assemblages. The northern region was likely colonized sometime during the mid-Pleistocene. Fish in the Brazos and Pecos Rivers probably reached these drainages through stream captures of the Red River. The large phylogenetic break between the northern/central and southern clades supports previous attempts to recognize two species of plains killifish: F. zebrinus and F. kansae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».