Determination of apparent calcium affinity for endogenously expressed human sarco(endo)plasmic reticulum calcium-ATPase isoform SERCA3
Notice bibliographique
Résumé
The sarco(endo)plasmic reticulum Ca(2+)-ATPases (SERCAs) play a crucial role in regulating free cytosolic Ca(2+) concentration in diverse cell types. It has been shown that recombinant SERCA3, when measured in heterologous systems, exhibits low apparent affinity for Ca(2+); however, Ca(2+) affinity of native SERCA3 in an endogenous setting has not been examined. Such a measurement is complicated, because SERCA3 is always coexpressed with the housekeeping isoform SERCA2b. We used a fluorescence-based assay for monitoring continuous Ca(2+) uptake into microsomes to examine the properties of endogenous human SERCA3 and SERCA2b. The kinetic parameters were derived using a cooperative two-component uptake model for Ca(2+) activation, and the values assigned to SERCA3 were confirmed using the highly specific human SERCA3 inhibitory antibody PL/IM430. First, using recombinant human SERCA3 and SERCA2b proteins transiently expressed in HEK-293 cells, we confirmed the previously observed low apparent Ca(2+) affinity for SERCA3 compared with SERCA2b (1.10 +/- 0.04 vs. 0.26 +/- 0.01 microM), and using mixtures of recombinant protein isoforms, we validated the two-component uptake model. Then we determined apparent Ca(2+) affinity for SERCA proteins present endogenously in cultured Jurkat T lymphocytes and freshly isolated human tonsil lymphocytes. The apparent Ca(2+) affinity in these two preparations was 1.04 +/- 0.07 and 1.1 +/- 0.2 muM for SERCA3 and 0.27 +/- 0.02 and 0.26 +/- 0.01 microM for SERCA2b, respectively. Our data demonstrate, for the first time, that affinity for Ca(2+) is inherently lower for SERCA3 expressed in situ than for other SERCA isoforms.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».