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Enregistrement W2111299117 · doi:10.1002/elps.200500460

Study of binding stoichiometries of the human immunodeficiency virus type 1 reverse transcriptase by capillary electrophoresis and laser‐induced fluorescence polarization using aptamers as probes

2005· article· en· W2111299117 sur OpenAlexaff
Hao Fu, Jeffrey Guthrie, X. Chris Le

Notice bibliographique

RevueElectrophoresis · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCapillary electrophoresisReverse transcriptaseFluorescence anisotropyLaser-induced fluorescenceFluorescenceHuman immunodeficiency virus (HIV)AptamerElectrophoresisVirologyChemistryMolecular biologyBiologyPolymerase chain reactionChromatographyOpticsGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Binding stoichiometries between four DNA aptamers (RT12, RT26, RTlt49, and ODN93) and the reverse transcriptase (RT) of the type 1 human immunodeficiency virus (HIV-1) were studied using affinity CE (ACE) coupled with LIF polarization and fluorescence polarization (FP). The ACE/LIF study showed evidence of two binding stoichiometries between the HIV-1 RT protein and aptamers RT12, RT26, and ODN93, suggesting that these aptamers can bind to both the p66 and p51 subunits of the HIV-1 RT. Only one binding stoichiometry for aptamer RTlt49 was found. The affinity complexes were easily separated from the unbound aptamers; however, the different stoichiometries were not well resolved. A complementary technique, FP, was able to provide additional information about the binding and supporting evidence for the ACE/LIF results. The ACE/LIFP study also revealed that the FP values of the 1:1 complexes of the HIV-1 RT protein with aptamers RT12, RT26, and ODN93 were always much greater than those of the 1:2 complexes. This was initially surprising because the larger molecular size of the 1:2 complexes was expected to result in higher FP values than the corresponding 1:1 complexes. This phenomenon was probably a result of fluorescence resonance energy transfer between the two fluorescent molecules bound to the HIV-1 RT protein.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,677

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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