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Enregistrement W2111339507 · doi:10.2337/db06-0065

Recognition of HLA Class I–Restricted β-Cell Epitopes in Type 1 Diabetes

2006· article· en· W2111339507 sur OpenAlexaff
Qin Ouyang, Nathan Standifer, Huilian Qin, Peter A. Gottlieb, C. Bruce Verchere, Gerald T. Nepom, Rusung Tan, Constadina Panagiotopoulos

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDiabetes and associated disorders
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesU.S. Public Health ServiceJuvenile Diabetes Research Foundation International
Mots-clésEpitopeHuman leukocyte antigenCytotoxic T cellImmunologyBiologyT cellAntigenIsletInsulinEndocrinologyInternal medicineImmune systemMedicineBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Type 1 diabetes results from the autoimmune destruction of insulin-producing pancreatic beta-cells by cytotoxic T-lymphocytes (CTLs). In humans, few beta-cell epitopes have been reported, thereby limiting the study of beta-cell-specific CTLs in type 1 diabetes. To identify additional epitopes, HLA class I peptide affinity algorithms were used to identify a panel of peptides derived from the beta-cell proteins islet amyloid polypeptide (IAPP), islet-specific glucose-6-phosphatase catalytic subunit-related protein (IGRP), insulin, insulinoma-associated antigen 2 (IA-2), and phogrin that were predicted to bind HLA-A*0201. Peripheral blood mononuclear cells from 24 HLA-A*0201 recent-onset type 1 diabetic patients and 11 nondiabetic control subjects were evaluated for gamma-interferon secretion in response to peptide stimulation in enzyme-linked immunospot assays. We identified peptides IAPP9-17, IGRP215-223, IGRP152-160, islet IA-2(172-180), and IA-2(482-490) as novel HLA-A*0201-restricted T-cell epitopes in type 1 diabetic patients. Interestingly, we observed a strong inverse correlation between the binding affinity of beta-cell peptides to HLA-A*0201 and CTL responses against those peptides in recent-onset type 1 diabetic patients. In addition, we found that self-reactive CTLs with specificity for an insulin peptide are frequently present in healthy individuals. These data suggest that many beta-cell epitopes are recognized by CTLs in recent-onset type 1 diabetic patients. These epitopes may be important in the pathogenesis of type 1 diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,185
Score d'incertitude au seuil0,590

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations103
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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