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Enregistrement W2111456931 · doi:10.1200/jco.2011.38.2697

Plasma MicroRNA Panel to Diagnose Hepatitis B Virus–Related Hepatocellular Carcinoma

2011· article· en· W2111456931 sur OpenAlexaff
Jian Zhou, Lei Yu, Xue Gao, Jie Hu, Jiping Wang, Zhi Dai, Jiefei Wang, Zhiyong Zhang, Shaohua Lu, Xiaowu Huang, Zheng Wang, Shuang‐Jian Qiu, Xiaoying Wang, Hui‐Chuan Sun, Zhao–You Tang, Ying Wu, Hongguang Zhu, Jia Fan

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineHepatocellular carcinomaCirrhosisInternal medicineHepatitis B virusmicroRNAReceiver operating characteristicOncologyCohortLiver cancerGastroenterologyLiver diseaseLogistic regressionHepatitis BCancerArea under the curveVirusImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: More than 60% of patients with hepatocellular carcinoma (HCC) do not receive curative therapy as a result of late clinical presentation and diagnosis. We aimed to identify plasma microRNAs for diagnosing hepatitis B virus (HBV) -related HCC. PATIENTS AND METHODS: Plasma microRNA expression was investigated with three independent cohorts including 934 participants (healthy, chronic hepatitis B, cirrhosis, and HBV-related HCC), recruited between August 2008 and June 2010. First, we used microarray to screen 723 microRNAs in 137 plasma samples for diagnosing HCC. Quantitative reverse-transcriptase polymerase chain reaction assay was then applied to evaluate the expression of selected microRNAs. A logistic regression model was constructed using a training cohort (n = 407) and then validated using an independent cohort (n = 390). Area under the receiver operating characteristic curve (AUC) was used to evaluate diagnostic accuracy. RESULTS: We identified a microRNA panel (miR-122, miR-192, miR-21, miR-223, miR-26a, miR-27a and miR-801) that provided a high diagnostic accuracy of HCC (AUC = 0.864 and 0.888 for training and validation data set, respectively). The satisfactory diagnostic performance of the microRNA panel persisted regardless of disease status (AUCs for Barcelona Clinic Liver Cancer stages 0, A, B, and C were 0.888, 0.888, 0.901, and 0.881, respectively). The microRNA panel can also differentiate HCC from healthy (AUC = 0.941), chronic hepatitis B (AUC = 0.842), and cirrhosis (AUC = 0.884), respectively. CONCLUSION: We found a plasma microRNA panel that has considerable clinical value in diagnosing early-stage HCC. Thus, patients who would have otherwise missed the curative treatment window can benefit from optimal therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations643
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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