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Enregistrement W2111533008 · doi:10.1128/jcm.01716-07

Capsular Polysaccharide Synthesis Regions in <i>Klebsiella pneumoniae</i> Serotype K57 and a New Capsular Serotype

2008· article· en· W2111533008 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesFar Eastern Memorial HospitalNational Taiwan University Hospital
Mots-clésSerotypeBiologyPyogenic liver abscessKlebsiella pneumoniaeMicrobiologyBacterial capsuleComplementationVirologyGenotypeTypingStrain (injury)GeneKlebsiellaStreptococcus pneumoniaePolymerase chain reactionGene clusterLiver abscessVirulenceGeneticsEscherichia coliAbscessAntibioticsPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Community-acquired pyogenic liver abscess caused by Klebsiella pneumoniae is an emerging infectious disease. We explored the capsular polysaccharide synthesis (cps) regions of three non-K1, non-K2 K. pneumoniae strains, A1142, A7754, and A1517, from Taiwanese patients experiencing pyogenic liver abscess. Two of the strains, A1142 and A7754, belonged to capsular serotype K57, while the third belonged to a new capsular serotype, different from the previously reported 77 serotypes. Deletion and complementation experiments suggested that a unique K57 gene, a homologue of wzy, was essential for K57 capsular synthesis and confirmed that this gene cluster was a genetic coding region for K57. Compared to K1 and K2 strains, the three strains were all serum sensitive, suggesting that host factors might also be involved in the three patients. PCR using primers from specific genes for K57 was more sensitive and specific than traditional serotyping. The remaining strain, A1517, did not react to the antisera from any of the 77 serotypes, and none of the 77 reference strains reacted to the serum against this strain. Moreover, PCR analyses using various primer pairs from the serotype-specific open reading frames did not reveal cross-reactivity to any of the 77 reference strains, suggesting that this strain likely represents a new capsular type. We conclude that sequences from these two cps regions are very useful in detecting K57 and the new cps genotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,560
Score d'incertitude au seuil0,806

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle