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Enregistrement W2111537023 · doi:10.1128/ec.00050-13

Characterization of <i>Tt</i> ALV2, an Essential Charged Repeat Motif Protein of the Tetrahymena thermophila Membrane Skeleton

2013· article· en· W2111537023 sur OpenAlexaff
Houda El-Haddad, Jude M. Przyborski, Lesleigh G. K. Kraft, Geoffrey I. McFadden, Ross F. Waller, Sven B. Gould

Notice bibliographique

RevueEukaryotic Cell · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTetrahymenaBiologyCytoskeletonCell biologyCytokinesisMicrotubuleBasal bodyMembrane proteinCell divisionGeneticsCellMembraneGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alveolins are a recently described class of proteins common to all members of the superphylum Alveolata that are characterized by conserved charged repeat motifs (CRMs) but whose exact function remains unknown. We have analyzed the smaller of the two alveolins of Tetrahymena thermophila, TtALV2. The protein localizes to dispersed, broken patches arranged between the rows of the longitudinal microtubules. Macronuclear knockdown of Ttalv2 leads to multinuclear cells with no apparent cell polarity and randomly occurring cell protrusions, either by interrupting pellicle integrity or by disturbing cytokinesis. Correct association of TtALV2 with the alveoli or the pellicle is complex and depends on both the termini as well as the charged repeat motifs of the protein. Proteins containing similar CRMs are a dominant part of the ciliate membrane cytoskeleton, suggesting that these motifs may play a more general role in mediating membrane attachment and/or cytoskeletal association. To better understand their integration into the cytoskeleton, we localized a range of CRM-based fusion proteins, which suggested there is an inherent tendency for proteins with CRMs to be located in the peripheral cytoskeleton, some nucleating as filaments at the basal bodies. Even a synthetic protein, mimicking the charge and repeat pattern of these proteins, directed a reporter protein to a variety of peripheral cytoskeletal structures in Tetrahymena. These motifs might provide a blueprint for membrane and cytoskeleton affiliation in the complex pellicles of Alveolata.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,164
Score d'incertitude au seuil0,407

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,175
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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