A Sentinel Platform to Evaluate Influenza Vaccine Effectiveness and New Variant Circulation, Canada 2010–2011 Season
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: During the 2010-2011 winter, a large number of outbreaks due to influenza A/H3N2 at long-term care facilities, including higher-than-expected attack rates among vaccinated staff, were reported in some regions of Canada. Interim analysis from the community-based sentinel surveillance system showed circulating H3N2 variants and suboptimal vaccine effectiveness (VE), assessed here for the entire season's data set. METHODS: Nasal/nasopharyngeal swabs and epidemiologic details were collected from patients presenting to sentinel sites within 7 days of onset of influenza-like illness. Cases tested positive for influenza by real-time reverse-transcription polymerase chain reaction; controls tested negative. Odds ratios for medically attended, laboratory-confirmed influenza in vaccinated vs nonvaccinated participants were used to derive adjusted VE. Viruses were characterized by hemagglutination inhibition (HI), and the hemagglutinin genes of a subset were sequenced to explore vaccine relatedness. RESULTS: Final 2010-2011 VE analysis included 1718 participants (half aged 20-49 years), 93 with A(H1N1)pdm09, 408 with A/H3N2, and 199 with influenza B. Among adults aged 20-49 years, adjusted VE was 65% (95% confidence interval [CI], 8%-87%) for A(H1N1)pdm09 and 66% (95% CI, 10%-87%) for influenza B. Vaccine effectiveness was substantially lower for A/H3N2, at 39% (95% CI, 0%-63%). Phylogenetic analysis identified 2 circulating H3N2 variant clades, A/HongKong/2121/2010 (87%) and A/Victoria/208/2009 (11%), bearing multiple amino acid substitutions at antigenic sites (12 and 8, respectively) compared with the H3N2 vaccine component used in Canada (A/Victoria/210/2009[NYMC X-187]). However, HI characterized all H3N2 isolates as well matched to the vaccine. CONCLUSIONS: Public health observations of increased facility H3N2 outbreaks were consistent with the sentinel network's detection of genetic variants and suboptimal VE but not with conventional HI characterization. We highlight the utility of a multicomponent sentinel surveillance platform that incorporates genotypic, phenotypic, and epidemiologic indicators into the assessment of influenza virus, new variant circulation, vaccine relatedness, and VE.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».