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Enregistrement W2111804623 · doi:10.3899/jrheum.141505

Downregulation of Tryptophan-related Metabolomic Profile in Rheumatoid Arthritis Synovial Fluid

2015· article· en· W2111804623 sur OpenAlexvenueno aff
Kwi Young Kang, Soo Hyun Lee, Seung Min Jung, Sung‐Hwan Park, Byung-Hwa Jung, Ji Hyeon Ju

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueTryptophan and brain disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKorea Institute of Science and TechnologyKorea Research Council of Fundamental Science and TechnologyMinistry of Science, ICT and Future PlanningNational Research Foundation
Mots-clésMetabolomicsMedicineSynovial fluidRheumatoid arthritisKynurenineInternal medicineMetabolic pathwayTryptophanKynurenine pathwayEndocrinologyImmunologyBiochemistryOsteoarthritisChemistryMetabolismAmino acidPathologyChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Synovial fluid (SF) is one of the most important materials that reflect the pathophysiological process of arthritis. A metabolomic and lipidomic study of SF was performed with the aim of identifying tentative diagnostic markers or therapeutic candidates for rheumatoid arthritis (RA). METHODS: SF was aspirated from 10 patients with RA and 10 patients with osteoarthritis (OA). RA SF and OA SF were collected and analyzed by ultraperformance liquid chromatography quadruple time-of-flight mass spectrometry. Associations among clinical variables, laboratory results, and metabolic profiles were investigated. RESULTS: The metabolic pathways for carnitine, tryptophan, phenylalanine, arachidonic acid, and glycophospholipid were significantly upregulated in OA SF. The metabolic pathways for taurine, cholesterol ester, and the β-oxidation of pristine acid, linolenic acid, and sphingolipid were activated more in RA SF than in OA SF. In particular, the tryptophan pathway, which comprises kynurenine, indoleacetic acid, indole acetaldehyde, and N'-formylkynurenine, was downregulated. Interestingly, the levels of tryptophan metabolites kynurenine and N'-formylkynurenine, which are involved in immune tolerance, were significantly lower in RA SF compared with OA SF (p < 0.05), but the opposite pattern was observed for erythrocyte sedimentation rate (p < 0.01) and the levels of C-reactive protein (CRP; p < 0.01), rheumatoid factor (p < 0.01), and anticyclic citrullinated peptide antibody (p < 0.05). Kynurenine concentration correlated inversely with CRP concentration in RA SF but not in OA SF (r -0.65, p < 0.05). CONCLUSION: Advances in metabolomic techniques enabled us to delineate distinctive metabolic and lipidomic profiles in RA SF and OA SF. RA SF and OA SF showed distinct metabolic profiles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,102
Score d'incertitude au seuil0,416

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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