Expression of a <i>Phytophthora sojae</i> necrosis‐inducing protein occurs during transition from biotrophy to necrotrophy
Notice bibliographique
Résumé
Phytophthora sojae is an oomycete that causes stem and root rot on soybean plants. To discover pathogen factors that produce disease symptoms or activate plant defense responses, we identified putative secretory proteins from expressed sequence tags (ESTs) and tested selected candidates using a heterologous expression assay. From an analysis of 3035 ESTs originating from mycelium, zoospore, and infected soybean tissues, we identified 176 putative secreted proteins. A total of 16 different cDNAs predicted to encode secreted proteins ranging in size from 6 to 26 kDa were selected for expression analysis in Nicotiana benthamiana using an Agrobacterium tumefaciens binary potato virus X (PVX) vector. This resulted in the identification of a 25.6-kDa necrosis-inducing protein that is similar in sequence to other proteins from eukaryotic and prokaryotic species. The genomic region encoding the P. sojae necrosis-inducing protein was isolated and the expression pattern of the corresponding gene determined by RNA blot hybridization and by RT-PCR. The activity of this P. sojae protein was compared to proteins of similar sequence from Fusarium oxysporum, Bacillus halodurans, and Streptomyces coelicolor by PVX-based expression in N. benthamiana and by transient expression via particle bombardment in soybean tissues. The P. sojae protein was a powerful inducer of necrosis and cell death in both assays, whereas related proteins from other species varied in their activity. This study suggests that the P. sojae necrosis-inducing protein facilitates the colonization of host tissues during the necrotrophic phase of growth.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».