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Enregistrement W2112028148 · doi:10.1128/aac.01267-08

Involvement of <i>pmrAB</i> and <i>phoPQ</i> in Polymyxin B Adaptation and Inducible Resistance in Non-Cystic Fibrosis Clinical Isolates of <i>Pseudomonas aeruginosa</i>

2009· article· en· W2112028148 sur OpenAlexaff
Kristen N. Schurek, Jorge Luiz Mello Sampaio, Carlos Roberto Veiga Kiffer, Sumiko I. Sinto, Robert E. W. Hancock

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolymyxinPolymyxin BPseudomonas aeruginosaMicrobiologyOperonBroth microdilutionBiologyPhenotypeColistinBacteriaMinimum inhibitory concentrationGeneAntibioticsMutantBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During investigation of susceptibility testing methods for polymyxins, 24 multidrug-resistant clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa were observed to have a distinct, reproducible phenotype in which skipped wells were observed during broth microdilution testing for polymyxin B. Possible mechanisms underlying this phenotype were investigated. The effects of various concentrations of polymyxin B on growth, the expression of resistance genes, and outer-membrane permeability were observed. Real-time PCR was performed to compare the expression, in response to selected concentrations of polymyxin B, of genes related to the PhoP-PhoQ and PmrA-PmrB two-component regulatory systems in polymyxin B-susceptible isolate PAO1, polymyxin B-resistant isolate 9BR, and two isolates (19BR and 213BR) exhibiting the skipped-well phenotype. 19BR and 213BR appeared to have similar basal levels of expression compared to that of PAO1 for phoQ, arnB, and PA4773 (from the pmrAB operon), and in contrast, 9BR had 52- and 280-fold higher expression of arnB and PA4773, respectively. The expression of arnB and PA4773 increased in response to polymyxin B in a concentration-dependent manner for 9BR but not for 19BR and 213BR. For these isolates, expression was significantly increased for arnB and PA4773, as well as phoQ, only upon exposure to 2 mug/ml polymyxin B but not at a lower concentration of 0.125 microg/ml. The sequencing of the pmrAB and phoPQ operons for all three isolates revealed a number of unique mutations compared to that for PAO1. 1-N-phenylnaphthylamine (NPN) was used to study the effect of preincubation with polymyxin B on the self-promoted uptake of polymyxin B across the outer membrane. The preincubation of cells with 2 microg/ml polymyxin B affected baseline membrane permeability in 19BR and 213BR and also resulted in a reduced rate of NPN uptake in these isolates and in PAO1 but not in 9BR. The results presented here suggest that the skipped-well isolates have the ability to adapt to specific concentrations of polymyxin B, inducing known polymyxin B resistance genes involved in generating alterations in the outer membrane.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,442
Score d'incertitude au seuil0,663

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations106
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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