Characterization of a novel family of fibronectin‐binding proteins with M23 peptidase domains from <i>Treponema denticola</i>
Notice bibliographique
Résumé
Interactions with fibronectin are important in the virulence strategies of a range of disease-related bacteria. The periodontitis-associated oral spirochaete Treponema denticola expresses at least two fibronectin-binding proteins, designated Msp (major surface protein) and OppA (oligopeptide-binding protein homologue). To identify other T. denticola outer membrane fibronectin-binding proteins, the amino acid sequence of the Treponema pallidum fibronectin-binding protein Tp0155 was used to survey the T. denticola genome. Seven T. denticola genes encoding orthologous proteins were identified. All but two were expressed in Escherichia coli and purified recombinant proteins bound fibronectin. Using antibodies to the N-terminal region of Tp0155, it was demonstrated that T. denticola TDE2318, with highest homology to Tp0155, was cell surface localized. Like Tp0155, the seven T. denticola proteins contained an M23 peptidase domain and four (TDE2318, TDE2753, TDE1738, TDE1297) contained one or two LysM domains. M23 peptidases can degrade peptidoglycan whereas LysM domains recognize carbohydrate polymers. In addition, TDE1738 may act as a bacteriocin based on homology with other bacterial lysins and the presence of an adjacent gene encoding a putative immunity factor. Collectively, these results suggest that T. denticola expresses fibronectin-binding proteins associated with the cell surface that may also have cell wall modifying or lytic functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».