Molecular phylogeny of the genus Philodendron (Araceae): delimitation and infrageneric classification
Notice bibliographique
Résumé
The genus Philodendron (Araceae) is a large neotropical group whose classification remains unclear. Previous classifications are based on morphological characters, mainly from the inflorescence, flower and leaf shape. The classification by Krause, with few modifications, is still the most commonly used system. To examine phylogenetic relationships in the genus, two ribosomal DNA nuclear markers, internal transcribed spacer (ITS) and external transcribed spacer (ETS), and the chloroplast intron rpl16, were sequenced and analysed for more than 80 species of Philodendron and its close relative Homalomena. According to the resulting phylogeny, the genus Homalomena may be paraphyletic to the genus Philodendron. The inclusion of the American Homalomena species within the genus Philodendron might resolve this taxonomic problem. All three subgenera of Philodendron were revealed as monophyletic. Below the subgeneric level, the groups obtained in our phylogeny globally correspond to sections recognized in previous classifications. Among the morphological characters used by previous taxonomists to build their classifications, and which we optimized onto one of the most parsimonious trees, most characters were found to be homoplasious. However, leaf shape, characteristics of the sterile zone on the spadix and venation patterns are useful for delimiting subgenera and sections within the genus. © 2008 The Linnean Society of London, Botanical Journal of the Linnean Society, 2008, 156, 13‐27.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».