The MHC class II chain cytoplasmic tail overcomes the invariant chain p35-encoded endoplasmic reticulum retention signal
Notice bibliographique
Résumé
The human-specific p35 isoform of the invariant chain (Ii) includes an R-X-R endoplasmic reticulum (ER) retention motif that is inactivated upon HLA-DR binding. Although the masking is assumed to involve the cytoplasmic tails of class II molecules, the mechanism underlying this function remains to be investigated. Moreover, in light of the polymorphic nature of the class II cytosolic tails, little is known about the capacity of various isotypes or alleles to overcome the retention signal of Iip35. To gain further insights into these issues, we first addressed the proposed role of the HLA-DR cytoplasmic tails. As shown by flow cytometry, the presence of Iip35 in transfected HeLa cells prevented surface expression of HLA-DR molecules lacking their cytoplasmic tails (DRalphaTM/betaTM). These truncated class II molecules and Iip35 accumulated in the ER, and co-localized with calnexin, as determined by confocal microscopy. Sensitivity of DRalphaTM/betaTM to endoglycosidase H treatment confirmed that these molecules do not reach the trans-Golgi network when associated with Iip35. Further characterization revealed that the beta chain cytosolic tail is critical for efficient ER egress of class II/Iip35 complexes. Interestingly, our results clearly demonstrate for the first time that DP and DQ isotypes can also overcome the retention motif of Iip35 through a mechanism involving their very distinctive polymorphic beta chain cytoplasmic tails. Altogether, these results further dissect the masking of di-basic retention signals, and emphasize the interplay between class II molecules and Ii for the transport of the complex to the endocytic pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».