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Enregistrement W2112235982 · doi:10.1093/jee/97.1.95

DNA-Based Identification of the Eastern Subterranean Termite, Reticulitermes flavipes (Isoptera: Rhinotermitidae)

2004· article· en· W2112235982 sur OpenAlexaboutno aff
Bart T. Foster, Anthony I. Cognato, Roger E. Gold

Notice bibliographique

RevueJournal of Economic Entomology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInsect and Arachnid Ecology and Behavior
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRhinotermitidaeReticulitermesBiologyMonophylyMitochondrial DNAHaplotypeZoologyEnvironmental DNADNA sequencingIdentification (biology)Evolutionary biologyPhylogeneticsGeneticsEcologyDNAGeneGenotypeCladeBiodiversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A DNA-based system for the identification of Reticulitermes flavipes (Koller) was established based on the following criteria: adequate molecular variation, comprehensive specimen sampling, explicit morphological species identification, and cladistic analysis. Termite soldiers were identified by labral shape, and these specimens and associated pseudergates were used in subsequent molecular analyses. Mitochondrial DNA from the AT-rich region was sequenced for 173 R. flavipes, Reticulitermes hageni Banks and Reticulitermes virginicus (Banks) soldiers and pseudergates collected from several widely dispersed Texan localities. Cladistic analysis was performed after exploration of an optimal sequence alignment inclusive of DNA sequences from Texas and published sequences from Georgia and Canada. Among the Texan individuals, 29, 5, and 1 mitochondrial DNA haplotypes were identified respectively with R. flavipes, R. hageni, and R. virginicus. One haplotype from El Paso likely represented a different Reticulitermes species. Species were monophyletic; however, individual relationships were unresolved in a strict consensus of 700 most parsimonious trees. Texas haplotypes were isolated by distance, and a correlation between genetic and geographic distance was observed among the Texas, Georgia, and Canada haplotypes. These results suggest that the methods outlined in this study will allow for the identification of R. flavipes from localities between Texas and Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,110
Score d'incertitude au seuil0,340

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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