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Enregistrement W2112267229 · doi:10.1139/b2012-018

Phylogeographic patterns in<i>Packera subnuda</i>reveal an east–west divergence along the Continental Divide and reduced haplotype diversity in northern populations

2012· article· en· W2112267229 sur OpenAlexafffundvenue
Jennifer Burke, Joanne L. Golden, Selina R. Dobing, John F. Bain

Notice bibliographique

RevueBotany · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyHaplotypePhylogeographyRange (aeronautics)Genetic diversityChloroplast DNADivergence (linguistics)Diversity (politics)PopulationEvolutionary biologyEcologyPhylogeneticsGenotypeGeneticsDemographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Packera subnuda (DC.) D.K. Trock & T.M. Barkley is a cordilleran species that is unusual within Packera in possessing diverse cpDNA haplotypes but no intrapopulational cpDNA diversity in the populations so far examined. In an effort to determine what factors are shaping this lack of diversity and whether it persists throughout the species, we sampled extensively throughout the range of the species. Unlike previous results, new population samples were not all monomorphic for cpDNA and some contained diverse haplotypes. Overall, the haplotype diversity pattern revealed, with one exception, a split into two groups separated by the Continental Divide. The exception (Beartooth Mountains, Wyo., USA) suggests the key factor in shaping the groups’ distributions may be the proximity to prairie populations of Packera species that increases the likelihood of hybridization. The pattern of diversity in ITS repeat type revealed in previous studies was also examined in more detail, with diversity found at both the intraindividual and intrapopulational level. ITS revealed a similar east–west separation into two groups on either side of the Continental Divide. Overall, the pattern suggests ancient hybridization injected haplotype and repeat type diversity into the species and that this diversity has since been reduced by the effects of drift in small populations, most significantly in populations at the northern and eastern edge of the range.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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