Phylogeographic patterns in<i>Packera subnuda</i>reveal an east–west divergence along the Continental Divide and reduced haplotype diversity in northern populations
Notice bibliographique
Résumé
Packera subnuda (DC.) D.K. Trock & T.M. Barkley is a cordilleran species that is unusual within Packera in possessing diverse cpDNA haplotypes but no intrapopulational cpDNA diversity in the populations so far examined. In an effort to determine what factors are shaping this lack of diversity and whether it persists throughout the species, we sampled extensively throughout the range of the species. Unlike previous results, new population samples were not all monomorphic for cpDNA and some contained diverse haplotypes. Overall, the haplotype diversity pattern revealed, with one exception, a split into two groups separated by the Continental Divide. The exception (Beartooth Mountains, Wyo., USA) suggests the key factor in shaping the groups’ distributions may be the proximity to prairie populations of Packera species that increases the likelihood of hybridization. The pattern of diversity in ITS repeat type revealed in previous studies was also examined in more detail, with diversity found at both the intraindividual and intrapopulational level. ITS revealed a similar east–west separation into two groups on either side of the Continental Divide. Overall, the pattern suggests ancient hybridization injected haplotype and repeat type diversity into the species and that this diversity has since been reduced by the effects of drift in small populations, most significantly in populations at the northern and eastern edge of the range.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».