SINE exonic insertion in the PTPLA gene leads to multiple splicing defects and segregates with the autosomal recessive centronuclear myopathy in dogs
Notice bibliographique
Résumé
Human centronuclear and myotubular myopathies belong to a genetically heterogeneous nosological group with clinical variability ranging from fatal disorder to mild weakness. The severe X-linked form is attributed to more than 200 different mutations in the myotubularin encoding gene (MTM1). In contrast, there are no reports regarding the molecular etiology or linkage studies on the autosomal forms of the disease. Labrador retrievers affected by spontaneous centronuclear myopathy (cnm) have clinical and histological features of the human disorder and represent the first model of recessive autosomal centronuclear myopathy. We previously mapped the cnm locus to the centromeric region of canine chromosome 2. No gene of the MTM1 family maps to the human homologous chromosomal region. Described herein is a disease-associated insertion within PTPLA exon 2, found in both alleles of all affected Labradors and in a single allele in obligate carriers. The inserted tRNA-derived short interspersed repeat element (SINE) has a striking effect on the maturation of PTPLA mRNA, whereby it can be spliced out, partially exonized or involved in multiple exon-skipping. As a result, the amount of wild-type transcripts falls to 1% in affected muscles. This example therefore recapitulates cumulative SINE-associated transcriptional defects that have been previously described as exclusive consequences of independent mutations. Although the function of PTPLA in metazoa remains unknown, the characterization of a hypomorphic mutation in Labradors with centronuclear myopathy provides new clues about the molecular complexity of skeletal myofiber homeostasis. These results also suggest that impaired PTPLA signaling might be implicated in human myopathies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».