SARS coronavirus protein 7a interacts with human Ap4A-hydrolase
Notice bibliographique
Résumé
The SARS coronavirus (SARS-CoV) open reading frame 7a (ORF 7a) encodes a 122 amino acid accessory protein. It has no significant sequence homology with any other known proteins. The 7a protein is present in the virus particle and has been shown to interact with several host proteins; thereby implicating it as being involved in several pathogenic processes including apoptosis, inhibition of cellular protein synthesis, and activation of p38 mitogen activated protein kinase. In this study we present data demonstrating that the SARS-CoV 7a protein interacts with human Ap4A-hydrolase (asymmetrical diadenosine tetraphosphate hydrolase, EC 3.6.1.17). Ap4A-hydrolase is responsible for metabolizing the "allarmone" nucleotide Ap4A and therefore likely involved in regulation of cell proliferation, DNA replication, RNA processing, apoptosis and DNA repair. The interaction between 7a and Ap4A-hydrolase was identified using yeast two-hybrid screening. The interaction was confirmed by co-immunoprecipitation from cultured human cells transiently expressing V5-His tagged 7a and HA tagged Ap4A-hydrolase. Human tissue culture cells transiently expressing 7a and Ap4A-hydrolase tagged with EGFP and Ds-Red2 respectively show these proteins co-localize in the cytoplasm.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».