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Enregistrement W2112506406 · doi:10.1139/g07-086

Microsatellite-based characterization of the <i>Castanea sativa</i> cultivar heritage of southern Switzerland

2007· article· en· W2112506406 sur OpenAlexvenueno aff
D. Gobbin, Leandro Hohl, Lisa Conza, Mauro Jermini, C. Gessler, Marco Conedera

Notice bibliographique

RevueGenome · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant and Fungal Interactions Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGermplasmMicrosatelliteHomonym (biology)CultivarSynonym (taxonomy)AdaptabilityBotanyGenusEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Southern Switzerland has a long tradition of chestnut cultivation as a staple food. Local inhabitants constantly selected varieties according to the ripening period, the type of use, and the adaptability to the territory. As a result, the panorama of chestnut varieties is very complex, as reflected by more than 120 different variety names in an area of 26,000 ha. Since 1994, 47 varieties have been conserved in the chestnut germplasm of southern Switzerland (CSS), including Marroni, Euro-Japanese, and French varieties. A selection of 164 individuals from the CSS was analysed by 8 SSR markers (4 of which were developed in this study). Microsatellite analysis indicated that the CSS was accurately established, as 86% of the individuals grafted were correctly labeled. The identification of 98 genotypes, 10 clonal chestnut groups, 4 synonym groups, and 12 homonym groups reflected the complex ethnogeographical structure of the chestnut distribution. The 17 Marroni individuals considered clustered in 2 differentiated genetic groups instead of only 1 as expected. The fundamental problem of the frequent cases of homonymy and synonymy is discussed, as is the need for criteria for discriminating between polyclonal varieties and distinct homonymous varieties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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